Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rdm1Q9CQK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rdm1Q9CQK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rdm1Q9CQK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rdm1Q9CQK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rdm1Q9CQK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms