Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15,9■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,89■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15,88■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15,87■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15,84■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Higd2aQ9CQJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Higd2aQ9CQJ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15,77■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Higd2aQ9CQJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms