Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQF4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9CQF4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQF4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms