Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClpsQ9CQC2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClpsQ9CQC2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClpsQ9CQC2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClpsQ9CQC2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpsQ9CQC2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms