Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpa3Q9CQ71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpa3Q9CQ71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpa3Q9CQ71 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpa3Q9CQ71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms