Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Slc24a3Q99PD7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc24a3Q99PD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc24a3Q99PD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms