Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GpnmbQ99P91 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GpnmbQ99P91 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GpnmbQ99P91 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms