Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab27bQ99P58 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab27bQ99P58 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab27bQ99P58 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab27bQ99P58 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms