Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl3Q99N95 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl3Q99N95 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl3Q99N95 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms