Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nus1Q99LJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nus1Q99LJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nus1Q99LJ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 969.4 ms