Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rcbtb2Q99LJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rcbtb2Q99LJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms