Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp16Q99LG0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp16Q99LG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp16Q99LG0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp16Q99LG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp16Q99LG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp16Q99LG0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp16Q99LG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp16Q99LG0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms