Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf2Q99LE6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcf2Q99LE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcf2Q99LE6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcf2Q99LE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 545.8 ms