Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nmd3Q99L48 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nmd3Q99L48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nmd3Q99L48 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms