Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmp1Q99KU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmp1Q99KU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmp1Q99KU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms