Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpifQ99KR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PpifQ99KR7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpifQ99KR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms