Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clint1Q99KN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clint1Q99KN9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms