Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd6Q99JI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd6Q99JI4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd6Q99JI4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms