Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8b1Q925Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc8b1Q925Q3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8b1Q925Q3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms