Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atad3Q925I1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atad3Q925I1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atad3Q925I1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atad3Q925I1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms