Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf7Q922B6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf7Q922B6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf7Q922B6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf7Q922B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf7Q922B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf7Q922B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Traf7Q922B6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf7Q922B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf7Q922B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms