Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpe65Q91ZQ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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