Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PccaQ91ZA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PccaQ91ZA3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PccaQ91ZA3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PccaQ91ZA3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms