Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Klc3Q91W40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klc3Q91W40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Klc3Q91W40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms