Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp3Q91W36 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp3Q91W36 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp3Q91W36 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp3Q91W36 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms