Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ppargc1bQ8VHJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms