Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SnrkQ8VDU5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SnrkQ8VDU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SnrkQ8VDU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SnrkQ8VDU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SnrkQ8VDU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms