Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx7Q8VDS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx7Q8VDS3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms