Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uhrf1Q8VDF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uhrf1Q8VDF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1Q8VDF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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