Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK5

Klhl20, Kelch-like protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl20Q8VCK5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl20Q8VCK5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl20Q8VCK5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl20Q8VCK5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms