Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc12Q8R344 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc12Q8R344 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc12Q8R344 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc12Q8R344 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms