Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mkl1Q8K4J6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mkl1Q8K4J6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mkl1Q8K4J6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mkl1Q8K4J6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms