Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OptnQ8K3K8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OptnQ8K3K8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
OptnQ8K3K8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OptnQ8K3K8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OptnQ8K3K8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms