Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsl1Q8K305 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsl1Q8K305 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsl1Q8K305 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsl1Q8K305 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms