Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Paf1Q8K2T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Paf1Q8K2T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paf1Q8K2T8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Paf1Q8K2T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Paf1Q8K2T8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms