Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FntbQ8K2I1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FntbQ8K2I1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FntbQ8K2I1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FntbQ8K2I1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FntbQ8K2I1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms