Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c1Q8K284 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf3c1Q8K284 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c1Q8K284 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms