Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcf3Q8K268 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcf3Q8K268 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcf3Q8K268 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcf3Q8K268 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms