Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spire2Q8K1S6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spire2Q8K1S6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Spire2Q8K1S6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spire2Q8K1S6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spire2Q8K1S6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms