Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx5Q8K1E0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx5Q8K1E0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx5Q8K1E0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms