Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TwnkQ8CIW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TwnkQ8CIW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TwnkQ8CIW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms