Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam20aQ8CID3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20aQ8CID3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam20aQ8CID3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms