Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SltmQ8CH25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SltmQ8CH25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SltmQ8CH25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SltmQ8CH25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SltmQ8CH25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms