Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upp2Q8CGR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Upp2Q8CGR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upp2Q8CGR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upp2Q8CGR7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms