Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps53Q8CCB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps53Q8CCB4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps53Q8CCB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps53Q8CCB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vps53Q8CCB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms