Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Podxl2Q8CAE9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Podxl2Q8CAE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Podxl2Q8CAE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms