Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc186Q8C9S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc186Q8C9S4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc186Q8C9S4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc186Q8C9S4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms