Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin9Q8C735 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin9Q8C735 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lin9Q8C735 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms