Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmnQ8C5W0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmnQ8C5W0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmnQ8C5W0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms