Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sfrp1Q8C4U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms